第一卷《緣起海花》，主要講述了主角海寶兒從出生被帶離武王朝至其十五歲這段時間的故事，故事篇幅佔比不多，總結來說，可以歸納為四個部分。
【第一部分】0-5 歲階段，為海寶兒的幼童時期。
這個階段，海寶兒家族覆滅，歷經波折來到海花島，在這裡過上了無憂無慮的生活。
幼童的他，喝百獸奶，得百獸緣，並且對身邊的一切都充滿好奇，每日除了陪伴幾位養父母外，就是熟悉海花島上的犄犄角角、邊邊落落。幼童海寶兒雖困於海島，但花草樹木，蟲魚鳥獸，都成為了他最為在意的東西。所以於他而言，一花一草皆風景，一蟲一獸亦有情。
【第二部分】5-15 歲階段，為海寶兒學習啟蒙時期。
從 5 歲生日那一天開始，海寶兒就順理成章地接受了九位養父母非常嚴苛的技能訓練——跟隨八爸關文貢學文練字，見乾坤，悟日月；跟隨九爸第五知本學醫治病，行仁心，譜大愛；跟隨六爸崔旻格物致知，鑄匠心，秉臻心；跟隨二爸、四爸習武練體，礪心智，修身德……總之，跟隨不同的人學習不同的本領，是海寶兒技能提升和三觀養成的最佳方式。
與此同時，在日常生活中，海寶兒還逐漸知曉了每個養父母很多不為人知的過往——二爸符元，江湖人稱“赤面狐”，年輕時曾與武朝公主有過一段刻骨銘心的愛情故事；四爸伍三曾，為兄弟之情怒殺紈絝，得罪權貴，被迫遠走海外避難；九爸第五知本，承先祖遺志，儒醫至德，濟世無我。
【第三部分】15 歲的那年，為海寶兒憧憬未來時期。
嚮往島外生活，是少年海寶兒一直堅持不懈的想法和願望，為了能夠順利出島，他試圖說服父母，同意外出遊歷，為了圓夢，他接受了養父母們對他的各項考核。
最後，不管是文考武試、醫術考核，還是經義策論、排兵佈陣，海寶兒都能從容應對，輕鬆過關，從而用實際行動證明了自己的實力。
【第四部分】開啟東萊之旅。
正當各項考核接近尾聲之時，兩件事情的突然發生打破了原本平靜的生活，也打亂了既定的考核計劃：第一件事是，與海寶兒一起長大的花豹“二喵”，突然在孤山深處離奇死亡，兇手不明；第二件事是，芭梔的一封家信帶來了東萊島內亂的訊息。眾人猜測，看似毫無關聯的兩件事情，其背後可能隱藏著同一個巨大的陰謀。
為了終結東萊內亂，幫助順義蕃族順利脫險，拯救東萊十萬島民於水火，同時為了儘快查出花豹的死因，找出真正的幕後指使，為“二喵”報仇，海寶兒如願以償地離開生活了十五年的海花島，登上了去往東萊島的海船。
踏入東萊後，海寶兒在戶堂辛哥的輔佐下，在騎樓老街開設了東萊島最大的醫館藥鋪——知本懸濟堂，以行醫賣藥、行商貿易之名，行幫助順義、調查內亂之實。