多爾濟終於如願以償，朝廷明令廢除了倉央嘉措的達賴喇嘛名號，赫壽並傳皇帝口喻，讓其尋找五世達賴轉世真身。可沒過多久，他就感到腳下的土地猶如翻滾的岩漿，人們用各種方法表達對倉央嘉措的懷念，洛桑寫的情歌，在城鎮、鄉村和草原廣泛傳唱，他的遭遇也引發人們的同情，甚至關於他的結局也流傳著多種版本。
多爾濟需要儘快找到所謂真正的六世達賴。
旺秋離開後，藥王廟住持從僧人中挑選了一名作江央的助手，他和江央是同學，叫曾巴，不但成績優秀，性格也忠厚老實，大家都清楚江央的家世，關照她，曾巴也深表同情。交往中，江央發現曾巴對自已的家世極力迴避，好像也從未回過家。
尼雅嫁給了西街一個商人，日子可算小康，時不時上山看望小姐。
有一天，江央得知，曾巴離開藥王山了，為什麼？往何處？沒人知道。
五月初，大昭寺貼出通告，十五日煨桑節上，六世達賴喇嘛將出席法會並作開示。大家一開始都很驚訝，弄不清怎麼回事，很快就傳出訊息，這位達賴是由拉昌汗剛找到，據說是個真的。江央有自已的想法，不過出於好奇，那天也去了。
新達賴是傍晚才出現的，加上滿城煙霧，瞧不大清楚，人們使勁向前擁擠，心態和表情如同是在觀看藏戲中一個演員。江央看著很眼熟，又見藥王廟的僧人都在嘁嘁喳喳，再定睛細瞅，不覺一驚，那不是曾巴嗎？他怎麼……而且她能察覺出曾巴內心的憂傷與無奈。
拉薩人是機靈敏銳的，而且不愛保密，沒多久，新達賴的背景和尋認過程就人盡皆知了。二十多年前，十王爺多爾濟看上了府中年輕守寡的熬茶廚娘。有了他們的孩子後，取名曾巴，送給東街一對乞丐夫婦，並贈與銀錢開了一家小店。廚娘每年都以姑姑名義探望兒子數次，孩子懂事後，漸漸覺得這位姑姑與自已關係不尋常，於是追問乞丐夫婦，看看瞞不住，只好告訴孩子，“姑姑”其實就是親生母親。
曾巴與廚娘相認後，自然要詢問生父是誰，廚娘只好推脫，說待長大些再告之。就這樣又過了三兩年，曾巴已感到自已身世蹊蹺，周圍鄰居的目光也變得複雜，十五歲那年，他決定出家，廚娘和養父母勸止不住，只好由他出家在不遠處一座小廟。藥王山醫學班開辦後，開始那些年只招收三大寺等大廟學員，不知透過什麼關係，曾巴破例入學，畢業後留在寺內擔任小執事。
多爾濟重新尋找五世達賴轉世靈童的過程非常簡單：按五世圓寂的時間推算，六世達賴該是二十四五歲，多爾濟列出了新達賴必須符合的若干條件，最後的結果是，只有他這個至今未見過面的兒子，是唯一全部達標的人選。
期間過程，外人不在跟前，無從知曉。可但凡歌舞民族都富於想象力，煨桑節後不出數日，吉朵即以說書的形式，演繹了這段秘史。共分四節：一、驚聞身世；二、父子相認；三、晴天霹靂；四、清冷坐床。頭一節內容曲折引人入勝。第二節的場面據說也頗為動人。第三節使聽眾均對“父親”面露不屑之色。第四節聽畢，僧俗眾生的態度明朗，也對這位無辜的年輕人明確表示同情。
這是一種特有的機智幽默，還未公開較量，已經先聲奪人。
坐床法會只有宮中喇嘛參加，根柱起先對新主人牴觸，當他後來探測到曾巴的內心深處時，也不禁投以同情。丹珠爾因根柱與洛桑的關係，派其做雜役，後來曾巴特意將其要到身邊做隨身侍從。
典禮後，多爾濟安排丹珠爾陪同曾巴赴三大寺——只要三大寺肯接納，新達賴的身份就名正言順了。沒想到，哲蚌寺和色拉寺閉門不納，甘丹寺雖然勉強開了門，但對曾巴沒有按歷來的習慣稱“佛爺”，只稱“閣下”。
多爾濟嗅到了濃重的危機意味兒，他清楚，如果新達賴得不到承認，自已將遭到蒙藏全體信眾的反對，也會被朝廷拋棄。他果斷採取了三項措施。
第二天，一支騎兵馳向敏珠林寺，宣讀了汗王府和第巴府決定，削減大部僧人，將多數殿堂沒收，移作他用，並任由騎兵在寺內縱馬踐踏。臨走時，一個頭目喝令把寺門上的木匾摘下，敏珠活佛上前一把抱住，說明此匾乃五世達賴親書所賜，不可毀壞。頭目張弓搭箭欲射，活佛轉身緊抱不捨，一箭飛來，穿透後心，八十歲的老活佛護匾身亡。騎兵乃去。該匾後由寺僧藏於洞內，七世達賴時又取出掛上，原物至今存於敏珠林寺內。
多爾濟透過打擊寧瑪，以示尊黃，其他紅教寺廟，如多吉扎寺、香色寺等寺廟均受波及，就連南傑盤德林寺也為逃過池魚之殃。
多爾濟的第二項措施，翻動了五世達賴所立、桑結嘉措致力鞏固的整個甘丹頗章政權的基石。大昭寺前張貼出兩府佈告，指斥桑結嘉措佞紅削黃，決定將收歸宮中所有、第巴府管理的三大寺屬地、牧場一律退還，另外對三大寺和黃教其他主要寺廟，賞賜大量土地，並取消對新建寺廟和僧人定額的限制。這樣的結果是，爾後三十年間，新增寺院一千七百座，總數達三千一百餘座；新增僧人二十二萬，總數近三十二萬；屬民由原來的極少量，增至六十四萬多人。
此外，主要寺院還擁有對僧眾和屬民的司法權。
如此，僅數十年，原本戒律嚴明的黃教和甘丹頗章根基受到嚴重侵蝕，有的現象真可說觸目驚心。乾隆年間，為克服藏中寺廟種種弊端，加強管理，出臺了兩部章程，在《欽定章程》（二十九條）之第十八條中，明確指出：“近查各大寺之活佛，擁有很多莊園，並因享有群眾信仰，所獻貢物者很多，再加經商謀利，貪財好貨，甚不稱職。”
物質財富的誘惑，政教合一的體制，使本來神聖的僧職、名號，變成逐利的手段，有的活佛及重要僧職，互為姻親或同出一族，故在《欽定章程》第一條中又明示，“大皇帝為了黃教的興隆，和不使護法弄假作弊”，“特賜一金瓶”，規定達賴、班禪、章嘉、哲布和雍和宮大喇嘛等黃教高層大活佛的靈童，必須經由金瓶掣籤法來確認。對其他大活佛轉世的確認也規定了嚴格辦法。
但爭奪沒有停息，甚至以極端形式蔓延到布達拉宮。
九世達賴十一歲於宮中暴亡。
十世達賴二十二歲於宮中暴亡。
十一世達賴十八歲於宮中暴亡。
十二世達賴二十歲於宮中暴亡。
厚厚的宮牆，不知遮掩了多少內幕。隨之而來的吏治腐敗、法度鬆弛，加劇了社會的不公。
乾隆對藏事多有研究，在《酌定西藏善後章程》（十三條）中，道出問題根源：“查舊例，全藏人民均屬達賴喇嘛所屬，按地方之大小，人戶之多寡，各有一定差徭，以供黃教佛事，並備眾僧熬茶之用。”然近時以來，“舊例廢馳”，“不但任意私為佔有，又復施恩於私人，濫行賞賚者甚多。”尤其對烏拉差役，私出牌票，種種加派，“以致百姓差徭加倍，苦累不堪，因此而致流離失所者甚多”。
根絕弊端的辦法，章程中指出“藏屬人民，應禁止私佔”，明顯是想恢復五世達賴時的狀況，但也只是說說而已，做不到了。
多爾濟的第三項措施，是設法讓曾巴得到五世班禪的認可。
他帶著重禮前往扎什倫布，向五世班禪獻上大片肥沃的農田牧場，然後告知：“五世達賴轉世真身已找到，請求師父前往拉薩授戒。”五世班禪默思良久，才說：“老僧可以前往拉薩，但老僧授戒，須保證兩件事：一、老僧須察看真身是否果真聰慧靈異，二、汗王須請出甘丹寺池巴主持法會儀式。”又說，“汗王，真身與否，關鍵在三大寺的態度，甘丹池巴乃大師化身，若能出面，方可服人心。”
1707年，康熙四十六年，甫過新年，五世班禪啟程，抵拉薩時，受到汗王府、第巴府、三大寺代表隆重歡迎。隨即住進布達拉，透過一個月的接觸，對曾巴這位勤奮好學、樸實厚道的年輕人，留下良好印象。得知曾巴曾在藥王山學醫並執教，交談之下，脫口讚道：“真乃好門巴。”後來有人據此稱之為門巴喇嘛，也有人推測，這其實是班禪佛爺暗示曾巴並非達賴真身。種種說法，不一而足。
二月二十五日，曾巴在宮中色喜彭措大經堂，向五世班禪磕頭，正式行了拜師禮。三月初八，在大昭寺釋迦牟尼像前，由甘丹池巴恰巴活佛主持，班禪為曾巴剃髮，授沙彌戒，取法名伊喜嘉措，承認了他的達賴喇嘛身份。
但如果新達賴還是進不了哲蚌和色拉的大門，其合法性將受質疑。經多方疏通，總算達成協議：由班禪佛爺分別為二寺部分僧眾授戒，屆時，伊喜嘉措可隨同前來，但只稱其為“閣下”。多爾濟聞之，也只得睜一眼閉一眼，含糊了事。四月十七日，二寺舉行了授戒法會。五世班禪為了表示謝意，共用數十萬斤青稞到三大寺熬茶、放佈施。
五世班禪直至七月中旬才離開拉薩，期間向曾巴傳授了多部顯密經典。
拉昌汗為報答，再向扎寺贈送多處莊園。
然而，還未等多爾濟喘口氣歇歇，安多方面又傳來訊息：以羅卜藏丹津為首，各位王公聯名向朝廷上書，狀告多爾濟所立達賴並非真身，欺瞞皇帝云云。此刻的康熙和多爾濟這兩位始作俑者，為這真真假假大傷腦筋。尤其是王公們在奏摺中流露出要“護教除奸”之意，令皇帝頓感緊張，於是立派大學士拉都渾赴藏“看驗”。
多爾濟向欽使說明，轉世靈童經五世班禪確認，“實系達賴喇嘛，我始為之安置禪榻，非敢專擅”。拉都渾回京稟報了“看驗”始末，議政大臣認為“拉昌所立達賴喇嘛，既問之班禪呼圖克圖，確知真實，應無庸議。”又建議，“青海眾臺吉等與拉昌不睦，西藏事務不便令拉昌獨理，應遣官一員前往西藏協同拉昌辦理事務。”康熙准奏，派侍郎赫壽前往。為避免矛盾激化，對達賴封號，“再閱數年，始議給封。”此為有清一代，特簡大臣駐藏辦事之始。
三年之後，即1710年，康熙四十九年，根據拉昌汗與赫壽請求，朝廷為伊喜嘉措頒賜印冊，正式封為六世達賴喇嘛。
從表面上看，新達賴完成了確認和冊封的程式，似乎可以告一段落，其實暗潮洶湧，局勢仍然不穩定。1713年，康熙五十二年，皇帝下諭：“班禪呼圖克圖，為人安靜，熟諳經典，勤修貢職，初終不倦，甚屬可嘉。著照封達賴喇嘛之例，給以印冊，封為班禪額爾德尼。”從此，班禪這一名號被朝廷認可，其後轉世均由中央政府正式冊封。清政府於此時抬高班禪的地位，顯然是希望他協助拉昌汗穩定局勢。